Erreger der durch Zecken übertragenen Erkrankung sind in Europa wahrscheinlich 3 pathogene Borrelienspezies der Gruppe Borrelia burgdorferi sensu lato: B. burgdorferi sensu stricto, B. afzelii,
B. garinii.
Die Diagnostik der Erkrankung gestaltet sich nach wie vor schwierig, zumal in Endemiegebieten sehr hohe Seroprävalenzen auch in der gesunden Pferdepopulation festgestellt werden. Eine Vielzahl klinischer Symptome wird beim Pferd mit Borrelien in Verbindung gebracht: Allgemeinstörungen, Gelenk-/Gliedmassenmanifestationen, Haut- , Augen- und Herzerkrankungen, neurologische Symptome bis hin zu Fortpflanzungsstörungen und Aborten. Dementsprechend vielfältig stellen sich auch die möglichen zur Untersuchung kommenden Materialien dar; am üblichsten beim Pferd sind die Erregerdiagnostik aus Synovia oder Liquor, evtl auch Haut. Der Erregernachweis aus dem Blut hat auch in einer Fieberphase wenig Aussicht auf Erfolg, da sich die Erreger im Gewebe und nicht über die Blutbahn verbreiten.