Die equine Influenza wird verursacht durch die beiden Subtypen Influenza A equi 1 (H7N7) und A equi 2 (H3N8), wobei Subtyp 1 in den letzten 30 Jahren kaum noch in Erscheinung trat. Bei empfänglichen Equiden führt die Infektion zu Fieber und einem rauen, trockenen Husten. In ungeimpften Populationen breitet sich das Virus rasch aus. Bakterielle Sekundärinfektionen mit muko-purulentem Nasenausfluss sind häufig und maskieren das klinische Bild v.a. in teilimmunen Populationen.
Die PCR aus Nasentupfern, TBS/BALF kann hier zu einer schnellen und sicheren Diagnose führen.